官方简介 日本将在未来建立信息自卫队（I-SDF）。建立这支部队被视为违反国际法和日本宪法，并加剧了日本、中国和朝鲜之间的紧张局势。朝鲜和中国最终在日本周围建立了航运封锁，促使日本以《战后宪法》第9条为由寻求美国的援助。在这段时间里，日本越来越多地了解到，蓄意的信息战袭击导致了臭名昭著的黑金日。在美国准备发射克拉伦斯·E·沃尔什号航空母舰之际，第三梯队派遣著名的萨姆·费舍尔执行一项似乎与该事件无关的任务。尽管如此，这可能是其中最关键的一个方面。玩家第三次在《分裂细胞：混沌理论》中扮演战地特工萨姆·费舍尔。
费舍尔这次有了一些新动作，还有一种新武器可供他使用：一把作战刀。山姆可以用刀杀死或击倒对手。玩家在每次任务结束时都会得到他们表现的概述。成功分数越高，玩家放过的人就越多。单人模式比前两款《分裂细胞》游戏更具扩展性。虽然玩家仍然被迫以“隧道”式的方式通过一些区域，无法选择他们想去的地方，但在许多情况下，他们可以选择如何到达那里。例如，在洞穴中，一个人可以杀死两个敌人并过桥，或者让他们独处，沿着小路偷偷走，最后爬上梯子，跳过战斗，但最终在同一个地方。在整个比赛过程中，许多地方都会被参观，包括灯塔、日本茶馆、首尔、东海岸停电期间的纽约市，以及其他异国情调的地方。上一款游戏的Spies vs Mercs多人模式已经回归，并增加了一些新功能。有新的大地图可以玩，还有上一场比赛的更新版本。此型号可在PC、PlayStation 2和Xbox版本上使用。